Если я буду ставить риск менеджер на Quik, это не может как-то повлиять на работу ATAS?

Надо смотреть как этот риск менеджер взаимодействует с Quik, проблем быть не должно, но будет ли он ограничивать заявки из ATAS сказать сложно. ATAS отправляет заявки через LUA, а этот менеджер может ограничивать риски только через интерфейс программы, в общем зависит от программы риск менеджера.